Как быть если при покупке дома в деревне выяснилось что он по факту 42 м кв общей площадью, а в реестре он 62 кв м ?

Ух, как вам не подфартило. Думаю можно в суд идти и снижать покупную стоимость...если повезет вернете часть денег назад. Советую давить на то, что вы видели только документы при покупке, а сам дом не смотрели...