Стоит ли прдавать долю в квартире агентству недвижимости?

Ячейку-то у банка снимают и гарантом того, что в ячейке окажутся деньги и никто их оттуда не "изымет" выступает именно банк - вы и покупатель заключаете договор с банком.

если в вашей ячейке не окажется денег - то эти деньги банк обязан будет вам выплатить в любом случае, а потом уже банк будет разбираться, как так вышло, кто виноват и с кем судится - но без вашего участия.

Здравствуйте. Скорее всего покупателем будет выступать представитель агентства недвижимости то есть физическое лицо. Не думаю что агентство будет Вас обманывать. У покупателей другой интерес, в последствии продать квартиру целиком. С вами наверняка договорились о приемлемой цене за долю в квартире.
Если есть опасения, наймите специалиста, который проведет данную сделку. Что касается денежных средств в банковской ячейке. Вы можете с покупателем, после регистрации перехода права собственности, вместе в банке изъять денежные средства из ячейки, после того как Вы убедитесь что все денежные средства на месте, отдать расписку о получении суммы в полном объеме.