Считается ли это перепланировкой ?

Наказуемы лишь незаконные перепланировки и переустройства.
перепланировки (т. е. изменения размеров и/или расположения помещений) в данном случае нет.
а вот под переустройством можно понимать внесение каких-либо изменений в существующую конструкцию.
если вы просто надстроите что-то, не меняя имеющегося, то это можно будет назвать "улучшением" или "обустройством", но не переустройством. "пере" предполагает демонтаж имеющегося. если такового не производить, то теоретически можно будет именно этими словами доказать, что поднятие подоконника не считается нарушением.