Если несколько собственников квартиры то у кого должна быть домовая книга? или несколько домовых книг?

Видимо Ваш вопрос сформулирован не совсем корректно. Домовая книга бывает только в одном экземпляре (или в электронном виде) и хранится в паспортном столе (или в администрации), а вот выписки из неё имеют право получить все зарегистрированные в квартире лица, а также любые заинтересованные лица по запросу уполномоченных органов.